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    斑點(diǎn)和狹縫雜交

    發(fā)布時(shí)間: 2022-03-24  點(diǎn)擊次數(shù): 1130次

    材料與儀器

    去離子甲酰胺 甲醛(37%) 20XSSC NaOH 預(yù)雜交液
    狹槽 點(diǎn)樣器 真空泵 可燙封塑料袋或雜交管 硝酸纖維 K 膜或尼龍膜 Whatman3MJV1 濾紙

    步驟

    一、材料與設(shè)備

    1) 狹槽

    2) 點(diǎn)樣器

    3) 真空泵

    4) 可燙封塑料袋或雜交管

    5) 硝酸纖維 K 膜或尼龍膜

    6)Whatman3MJV1 濾紙

    7) 去離子甲酰胺

    8) 甲醛(37%)

    9)20XSSC

    10)0.1mol/LNaOH

    11) 預(yù)雜交液:50% 甲酰胺,5XSSC,2XDenhardt, 0.1%SDS,100ug/ml 鮭精 DNA。

    二、操作方法

    (-)樣品處理

    將 l0ulRNA10ug,(RNA 可多至 50ug) 水溶液與下述溶液混合:

    甲酰胺                                                  20ul

    甲醛(37%)                                                     7ul

    20XSSC                                                          2ul

    于 60℃ 溫育 15 min 使其變性,冰浴冷卻樣品。

    (二)點(diǎn)樣

    用 0.lmol/LNaOH 清洗點(diǎn)樣器,再用 DEPC 水充分沖洗。將一張經(jīng) 20XSSC 浸潤(rùn)的 Whatman3 MM 濾紙鋪在點(diǎn)樣器上,上面鋪張經(jīng) 20XSSC 浸潤(rùn) 30 min 的硝酸纖維素膜,加蓋并夾緊,接通真空泵。用 10XSSC 清洗各樣孔。在每一 RNA 樣品中加 2 倍體積的 20XSSC,混合后加樣。于外圍幾個(gè)孔中加染料定位,緩慢抽吸,毎孔用 lml10XSSC 淸洗 2 次。繼續(xù)抽吸 5 min,吸干濾膜。

    (三) 固定

    取出濾膜,室溫晾干后,夾在 2 張 Whatman3 MM 濾紙中間,80℃ 干烤 2 h 以固定RNA

    (四)預(yù)雜交

    濾膜烘干后放入可燙封塑料袋 (或雜交管)中,加入 20?30 ml 預(yù)雜交液,密封塑料袋后在 42°C 預(yù)雜交 3 h

    (五)探針制備及標(biāo)記

    參見(jiàn)前面相關(guān)章節(jié)。

    (六)雜交

    將已標(biāo)記的探針煮沸變性 l0 min,取出后立即置冰浴 10 min(單鏈探針不需要變性),將變性探針加入預(yù)雜交液中,密封雜交塑料袋后在 42℃ 雜交過(guò)夜。

    (七)洗膜

    雜交結(jié)束后,分別用下列洗液洗膜:

    1)2XSSC,0.5%SDS,室溫洗膜 5 min。

    2)1XSSC,0.1%SDS,42°C 洗膜 30rnin。

    0.1XSSC,0.5%SDS,56℃ 洗膜 30 min。

    (八)檢測(cè)

    用 X 射線片進(jìn)行放射性自顯影,附加增感屏,一 70°C 曝光 7?10 天。

    注意事項(xiàng)

    1) 使用快速制備法獲得的細(xì)胞總 RNA 有可能污染基因組 DNA, 因此難以用分光光度計(jì)來(lái)精確測(cè)定 RNA 含量。此外還必須防止上樣矯作物的出現(xiàn)。對(duì)半定最分析來(lái)說(shuō),每一樣品須做兩次狹縫印跡,一張膜與所要檢測(cè)的 RNA 探針雜交,另一張則與另-種RNA 探針雜交,這種在各個(gè)樣品中的表達(dá)都應(yīng)一樣,或者也可以對(duì)一個(gè)樣品制作-次印跡,但同一張膜必須進(jìn)行兩次重復(fù)雜交。

    2)RNA 樣品在點(diǎn)樣時(shí)要稀釋 8 倍,因此樣品的濃度至少為 10mg/mL

    3) 狹縫雜交很容易出現(xiàn)假陽(yáng)性性信號(hào)。這可通過(guò)以下手段盡可能的避免:①用 Northern 印跡方法嚴(yán)格鑒定探針的特異性;②在所用測(cè)試中均需要有適當(dāng)?shù)年幮詫?duì)照;③須非常細(xì)心地制備所用探針、溶液、RNA 等以避免污染。

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